Transition　metal　selenides　nanoparticles/carbon　composites　have　been　one　of　the　promising　lithium/sodium　ion　battery　anodes.　In　the　present　study,　NiSex　nanoparticles　encapsulated　into　microporous　flowerlike　carbon　have　been　prepared　by　a　hydrothermal　route　directed　by　the　flowerlike　Ni/C　composite　template.　In　a　low　hydrothermal　temperature　(i.e.,　120　degrees　C),　the　metallic　Ni　nanoparticles　are　transformed　into　Ni0.85Se,　which　has　an　average　particle　size　of　similar　to　13.02　nm.　The　selenization　degree　and　particle　size　can　be　obviously　improved　at　a　higher　hydrothermal　temperature　(i.e.,　160　or　180　degrees　C),　accompanying　with　the　decrease　in　carbon　content,　and　partial　Ni0.85Se　nanoparticles　have　been　transformed　into　NiSe2.　As　anode　of　lithium　ion　batteries,　the　NiSex　obtained　at　180　degrees　C　(i.e.,　180　degrees　C-NiSe)　can　deliver　a　higher　discharge　capacity　(e.g.,　851.0　mA　h　g(-1)　after　100　cycles　at　0.2　A　g(-1))　and　better　cycling　stability　compared　with　the　low　temperature　obtained　sample.　However,　the　rate　capability　and　sodium　ion　storage　performance　of　120　degrees　C-Ni0.85Se　are　better　than　the　180　degrees　C-NiSex,　and　a　discharge　capacity　of　326.5　mA　h　g(-1)　can　be　reached　at　a　high　rate　of　5　A　g(-1)　for　120　degrees　C-Ni0.85Se.　Also,　a　high　capacity　retention　ratio　of　64.3%　after　100　cycles　can　be　reached　for　120　degrees　C-Ni0.85Se　as　sodium　ion　battery　anode.　The　different　electrochemical　performance　can　be　attributed　to　the　decreased　particle　size.