为深入分析知识聚合对区域创新能力的影响机理,从自有知识和知识流动两个方面构建知识聚合测度指标体系,以2009-2015年中国30个省(市、自治区)的面板数据为样本,运用永续盘存法和熵权法对知识聚合进行测度;在此基础上,实证考察了知识聚合对区域创新能力的影响及其区域差异.结果表明:中国省际知识聚合大致呈现一种东高西低的非均衡态势,四大区域间差异明显,且伴有扩大趋势;在控制了研发经费投入强度、政府支持程度和区域创新机构数等条件下,省际知识聚合对总体区域创新能力具有显著的正向影响,而对分区域创新能力影响存在明显的区域差异,其中,中部地区知识聚合较西部地区知识聚合对区域创新能力的提升作用更大,东北地区知识聚合对区域创新能力具有抑制作用,东部地区知识聚合影响不显著;自有知识对区域创新能力的促进作用大于知识流动,且二者在影响区域创新过程中存在着显著的＂互斥效应＂.