资金的保障程度决定着自然保护区发展的兴衰成败，应采取切实可行的措施确保充足的资金用于自然保护区管理中。我国自然保护区资金方面存在的问题包括两方面，就资金投入而言，体现为资金来源渠道单一化，资金数额严重不足，资金补助制度不合理；就资金使用而言，体现为使用效率偏低，欠缺监督管理。自然保护区实行资金信托保障机制具有明显的优势，体现为信托资产的独立性可以保证在实现信托目的的同时能够对资金进行合理再分配，信托融资管理功能方面具有多渠道资金来源，科学的监督管理体系能够确保资金合理高效投入。构建自然保护区资金信托的基本框架包括设立信托基金和实施信托管理两方面，前者包括设立政府基金和社会公益基金，后者包括设立信托管理机构和明确信托管理机构的职责。