企业的创新战略和融资决策是企业可持续发展的关键，而现实中资本结构决策是由公司和行业两个层面的因素共同作用的结果，因此，本文利用跨层次研究模型检验了不同行业特征以及公司层面自身因素对公司资本结构的内在作用机制。研究发现：（1）行业特征是影响微观企业资本结构的重要因素，跨级相关系数值（ICC）显示了行业特征可以解释资本结构变异的9．67％的方差；（2）大多数上市公司在实行创新战略时往往通过债务融资的方式，面临着很大的困境和财务风险；（3）行业竞争程度既对公司资本结构有着显著的直接作用，也会通过影响公司创新战略来间接影响资本结构决策，即行业竞争能够促使公司在采取创新战略时，保持一个较低的负债水平，从而降低由于采取创新战略带来的高风险；（4）行业成长性对公司资本结构决策具有间接作用，即行业成长性会加强创新战略与资本结构之间的内在关系，也就是说，处于成长阶段的行业内公司在采取创新战略时，更多地是借助债务融资来实施。