传统PCR(polymerase　chain　reaction)仪对样品反应池壁温度进行接触式测量与温控,存在测量迟滞大、无法直接控制试剂温度的缺点.研制的电化学实时定量PCR温控系统采用红外温度传感器、热源温度传感器以及环境温度传感器分别测量试剂表面热辐射、热源与反应池壁温度与环境温度,并提出序贯双卡尔曼滤波估计算法对三点温度数据进行信息融合从而估计出试剂表面温度真实值.该算法中迭代卡尔曼滤波器(iterated　extended　Kalman　filter,IEKF)与线性卡尔曼滤波器(Kalman　filter,KF)顺序运行,结合了IEKF非线性估计收敛快与KF实时性高的优点,克服了红外测温噪声大,易受环境、被测物热辐射率等因素影响的缺点.试剂温度的估计值作为反馈输入到基于FPAA(field　programmable　analog　array)的可动态配置PID控制器中构成闭环控制,同时微控制器根据不同温控阶段的控制要求对PID控制器进行配置,从而提高温控效率.实验表明,滤波估计后红外测温精度由2℃提高至0.3℃；试剂表面温度监控与可动态配置PID使得PCR温控更加准确高效；PCR产物测试结果优于市面上PCR仪、恒温时间设置更加合理.