Abstract:
传统的功能基因多样性研究主要采用PCR扩增片段构建文库及Sanger测序进行的,具有工作量大,耗时长,费用高和覆盖率低的不足。本研究采用基于Illumina HiSeq2500高通量测序平台对大布苏盐碱湖底泥宏基因组中的第10家族木聚糖酶基因多样性进行了研究。对扩增子测序后共获得227,420个读长,总长度约为49.5 Mbp。基于95%的一致性分析共获得467个可操作聚类单元(OTUs),其中有392个注释为木聚糖酶,比采用构建文库的方法获得的OTU数目要多300多个。这些OTU与GenBank数据库中的一致木聚糖酶蛋白序列的一致性范围为35-99%,其中75%与已知木聚糖酶序列的一致性在8...
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Year: 2019
Language: Chinese
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