Phosphorus　(P)　cycling　by　microbial　activity　is　highly　relevant　in　the　eutrophication　of　lakes.　In　this　context,　the　contents　of　organic　(Po)　and　inorganic　(Pi)　phosphorus,　the　activity　of　acid　(ACP)　and　alkaline　(ALP)　phosphomonoesterase　(Pase),　and　the　abundances　of　bacterial　Pase　genes　(phoD,　phoC,　and　phoX)　were　studied　in　sediments　from　Budi　Lake,　a　eutrophic　coastal　brackish　water　lake　in　Chile.　Our　results　showed　spatiotemporal　variations　in　P　fractions,　Pase　activities,　and　Pase　gene　abundances.　In　general,　our　results　showed　higher　contents　of　Pi　(110–144　mg　kg−1),　Po　(512–576　mg　kg−1),　and　total　P　(647–721　mg　kg−1)　in　sediments　from　the　more　anthropogenized　sampling　sites　in　summer　compared　with　those　values　of　Pi　(86–127　mg　kg−1),　Po　(363–491　mg　kg−1)　and　total　P　(449–618　mg　kg−1)　in　less　anthropogenized　sampling　sites　in　winter.　In　concordance,　sediments　showed　higher　Pase　activities　(μg　nitrophenyl　phosphate　g−1　h−1)　in　sediments　from　the　more　anthropogenized　sampling　sites　(9.7–22.7　for　ACP　and　5.9　to　9.6　for　ALP)　compared　with　those　observed　in　less　anthropogenized　sampling　sites　in　winter　(4.2–12.9　for　ACP　and　0.3　to　6.7　for　ALP).　Higher　abundances　(gene　copy　g−1　sediment)　of　phoC　(8.5–19　×　108),　phoD　(9.2–47　×　106),　and　phoX　(8.5–26　×　106)　genes　were　also　found　in　sediments　from　the　more　anthropogenized　sampling　sites　in　summer　compared　with　those　values　of　phoC　(0.1–1.1　×　108),　phoD　(1.4–2.4　×　106)　and　phoX　(0.7–1.2　×　106)　genes　in　the　less　anthropogenized　sites　in　winter.　Our　results　also　showed　a　positive　correlation　between　P　contents,　Pase　activities,　and　abundances　of　bacterial　Pase　genes,　independent　of　seasonality.　The　present　study　provided　information　on　the　microbial　activity　involved　in　P　cycling　in　sediments　of　Budi　Lake,　which　may　be　used　in　further　research　as　indicators　for　the　monitoring　of　eutrophication　of　lakes.　©　2022　Elsevier　Ltd