目的　使用基因芯片检测水中尸体的组织样本及现场水样中的硅藻，探讨该技术在溺亡案例中的应用价值。方法　收集2021年7月至2022年4月间，在中山市河流辖域内出现的水中尸体19具，使用硅藻基因芯片技术检测每具水中尸体的肺、肝、肾组织及现场水样，并对其中7具水中尸体的28份样本也进行显微镜硅藻检测，分析样本中的硅藻检验情况。结果　在28份使用两种方法检验的样本中，基因芯片方法检出的硅藻类型比显微镜方法检出的硅藻类型多，差异具有统计学意义（P＜0.05）。在所有使用基因芯片检测的样本中，组织样本与水样中的硅藻类型差异没有统计学意义（P　＞　0.05）。就组织样本而言，肺组织易检出硅藻，且检出的硅藻类型比肝、肾组织多。基因芯片技术检测肺、肝、肾组织的硅藻发现，越靠远端的组织检出的硅藻类型数量有减少趋势，且硅藻类型间的差异度有增加趋势。结论　基因芯片可有效检出水中尸体的硅藻类型和分布特征，在水中尸体的溯源分析、死亡原因等研究中具有较大潜力。