原位监测海水中氨氮（NH_3-N）和亚硝酸盐（NO_2~-）对于水体富营养化评价十分重要。针对现有的氨氮、亚硝酸盐原位监测仪器难以在同一检测模块中分别实现荧光和分光光度分析，仪器高效集成及利用受到限制等问题，本文基于光纤耦合微通道反应系统，通过光波长切割、光纤波导和微通道反应Z型检测池等技术集成和条件优化，提出了在同一光纤偶联微反应系统中实现氨氮荧光分析和亚硝酸盐分光光度分析的原位测定技术。结果表明，该技术实现了荧光和可见光光度法的模式切换并可分别测定NH_3-N和定；不同的盐度对氨氮和亚硝酸盐测定影响较小；不同浊度下氨氮测定误差为-6.6%～2.5%，浊度补偿校正后NO_2~-测定误差小于0.1%。将该仪器应用于养殖海水中开展氨氮和亚硝酸盐的原位分析，仪器原位监测值与实验室方法测定值相符合。本文所提出的技术在同一模块中分别实现了氨氮和亚硝酸盐的荧光和分光光度两种模式的原位监测，为海水营养盐原位监测仪器的集成化设计提供了新的思路。