中小企业向专精特新升级是促进区域产业发展的重要动力。如何协同多元制度逻辑促进区域中小企业向专精特新发展是中小企业创新研究亟需回答的现实问题。为此，本文基于制度逻辑理论，结合fsQCA方法，从组态视角分析多重制度逻辑与中小企业向专精特新升级的关系。研究发现：(1)驱动中小企业向专精特新升级的主导逻辑呈现出政策逻辑、市场逻辑、技术逻辑与文化逻辑混合并存的多元差异化特征。(2)政策-市场-技术多元驱动型、文化支撑乏力下技术主导型这两种组态可以产生高专精特新水平，前者侧重于普惠金融、产业集聚与创新投入的协同推动作用，后者则更关注在文化逻辑核心缺失时创新投入的主导作用。导致非高专精特新水平的两种制度组态均呈现出政策、市场与技术逻辑的核心缺失，说明中小企业向专业化、精细化、特色化与新颖化发展要通过政府与市场的“互惠之手”强化中小企业与产业链上下游龙头企业的技术经济联系，同时通过企业数字化转型进行设计与工艺创新，加大数字技术对制造产业的渗透与融合。(3)中国东中西部与东北地区中小企业向专精特新的升级路径存在明显差异，建议各地立足优势产业链发展节点寻求产业政策支持或市场机会，特别是处于中西部与东北地区的中小企业，跨越资源禀赋差异寻求产业内规模较大企业的资源支持更有利于创新活动的开展。