目的　分析甲状腺癌患者基因变异与临床病理特征的相关性。方法　结合高通量测序检测甲状腺肿瘤基因变异的结果与临床病理特征进行相关性分析。结果　238例甲状腺癌中93.7%存在Ⅰ类或Ⅱ类变异。与癌症基因组图谱(TCGA)相比，本中心队列甲状腺乳头状癌(papillary　thyroid　cancer,　PTC)患者的平均年龄较小(44.4±12.4岁vs　46.8±15.5岁，P=0.043),淋巴结转移率较高(57.5%vs　49.2%;P=0.046),BRAF突变的发生率较高(82.4%vs　59.7%,P＜0.001),而RAS突变(2.3%vs　12.9%,P＜0.001)和TERT启动子突变(1.8%vs　9.4%,P＜0.001)的发生率较低，RET融合(5.4%vs　6.8%,P=0.484)和NTRK融合(4.1%vs　2.1%,P=0.127)则无差别。在221例PTC队列中95.0%患者存在基因变异，分别为BRAF(182/221,82.4%)、RET融合(12/221,5.4%)、NTRK融合(9/221,4.1%)、FGFR扩增(6/221,2.7%)、CCND1扩增(6/221,2.7%)、FGF19扩增(6/221,2.7%)、RAS(5/221,2.3%)、PIK3CA(5/221,2.3%)和TERT启动子(4/221,1.8%)等。NTRK融合与年龄较小(P=0.049)和T分期更高(P=0.005)相关，而TERT启动子突变与年龄较大(P=0.003)和T分期更高(P=0.001)相关。8.6%(19/221)的PTC患者具有至少2个驱动基因变异，且倾向于发生在年龄较大(P=0.001)和T分期更高(P=0.001)的患者中，更容易出现淋巴结转移。BRAF较高的突变丰度与T分期(P＜0.001)和N分期(P=0.017)相关。结论　中国PTC患者具有独特的基因变异特征；NTRK融合、TERT启动子突变、多个驱动基因变异或BRAF较高的突变丰度患者表现出特殊的临床病理特征。